La microbiologia è una branca della biologia che studia la struttura e le funzioni dei microrganismi, cioè di tutti quegli organismi viventi unicellulari, pluricellulari o acellulari, non visibili ad occhio nudo quali  batteri, Archaea, alcuni tipi di funghi, lieviti, alghe e protozoi.
La microbiologia studia inoltre i virus e i prioni, sebbene questi non siano classificati come esseri viventi in senso stretto.

Principali attività diagnostiche della sezione

• Batteriologia.
• Micologia.
• Protozologia.
• Virologia.